
Klasifikasi tumbuhan kedelai ialah sebagai diberikut :
Kingdom : Plantae (Tumbuhan)
Subkingdom : Tracheobionta (Tumbuhan berpembuluh)
Super Divisi : Spermatophyta (Menghasilkan biji)
Divisi : Magnoliophyta (Tumbuhan berbunga)
Kelas : Magnoliopsida (berkeping dua / dikotil)
Sub Kelas : Rosidae
Ordo : Fabales
Famili : Fabaceae (suku polong-polongan)
Genus : Glycine
Spesies : Glycine max (L.) Merr.
Morfologi Tanaman Kacang Kedelai (Glycine max L. )
Akar
Salah satu kekhasan dari sistem perakaran tumbuhan kedelai ialah adanya interaksi simbiosis antara kuman nodul akar (Rhizobium japanicum) dengan akar tumbuhan kedelai yang menjadikan terbentuknya bintil akar. Bintil akar sangat berperan dalam proses fiksasi Nitrogen yang sangat diharapkan tumbuhan kedelai untuk kelanjutan pertumbuhannya (Sarwanto. 2008).
Batang

Daun
Jarak daun kedelai selang-seling, mempunyai 3 buah daun (triofoliate), jarang mempunyai 5 lembar daun, petiola berbentuk panjang menyempit dan slinder stipulanya terbentuk panjang menyempit dan slinder, stipulanya terbentuk lanseotlat kecil, dan stipel kecil lembaran daun berbentuk oval menyirip, biasanya palea bewarna hijau dan awal berbentuk bulat. Ujung daun biasanya tajam atau tumpul, lembaran daun samping sering agak miring, dan sebagian besar kultivar menjatuhkan daunnya dikala buah polong mulai matang
Bunga
Bunga kedelai disebut bunga kupu-kupu dan ialah bunga sempurna. Bunga kedelai mempunyai 5 helai daun mahkota, 1 helai bendera, 2 helai akup, dan 2 helai tunas. Benang sarinya ada 10 buah, 9 buah diantaranya bersatu pada bab awal membentuk seludang yang mengelilingi putik. Benang sari kesepuluh terpisah pada bab awalnya, seakan-akan epilog seludang. Bunga tumbuh diketiak daun membentuk rangkaian bunga terdiri atas 3 hingga 15 buah bunga pada tiap tangkainya
Buah

Biji
Biji kedelai mempunyai bentuk, ukuran, dan warna yang beragam, bergantung pada varietasnya. Bentuknya ada yang lingkaran lonjong, bulat, dan lingkaran agak pipih. Warnanya ada yang putih, krem, kuning, hijau, cokelat, hitam, dan sebagainya. Warna-warna tersebut ialah warna dari kulit bijinya. Ukuran biji ada yang berukuran kecil, sedang, dan besar. Namun, di luar negeri, contohnya di Amerika dan Jepang biji yang mempunyai bobot 25 g/100 biji dikategorikan berukuran besar